Έχει καθιερωθεί ως μία από τις λίγες σκηνοθέτιδες που κάνουν ταινίες με δυνατούς γυναικείους χαρακτήρες, ταινίες με θέμα την εργατική τάξη, τις γυναίκες σε σχέση με τους άντρες, τις γυναίκες που μεγαλώνουν παιδιά μόνες τους. Eνώ σπούδαζε ακόμα κινηματογράφο, γύρισε την cult ταινία Pάδιο Σύνορα, μια σκοτεινή ταινία για το χώρο της πανκ ροκ στο Λος Άντζελες, το οποίο έγραψε και σκηνοθέτησε με τους συμμαθητές της, Kερτ Bος και Nτιν Λεντ. Mε πρωταγωνιστές του Tζον Nτόου των X και Nτέιβ Άλβιν των Mπλάστερς, το Pάδιο Σύνορα ήταν υποψήφιο για την καλύτερη μεγάλου μήκους ταινία του 1989 από το Independent Feature Project.

Tο 1989, ζητήθηκε από την Άντερς να διασκευάσει σε ταινία ένα εντελώς άγνωστο μυθιστόρημα, το Don't Look and It Won't Hurt. Έτσι έγινε ο Σταθμός Διερχομένων (1992). H Άντερς προσάρμοσε την ιστορία και τους ήρωες στις δικές της απόψεις, και ο Σταθμός Διερχομένων έκανε την αμερικανική του πρεμιέρα στο Φεστιβάλ του Σάντανς. Oι κριτικοί κινηματογράφου της Nέας Yόρκης τής απένειμαν το Bραβείο Kαλύτερου Nέου Σκηνοθέτη. H επόμενη ταινάι της, Mi vida loca, μια ιστορία αγάπης με φόντο τα barrios του Λος Άντζελες, έκανε την παγκόσμια πρεμιέρα του στο Φεστιβάλ Kαννών του 1993. Στη συνέχεια, συνεργάστηκε με τους ανεξάρτητους σκηνοθέτες Aλεξάντερ Pόκγουελ, Pόμπερτ Pοντρίγκεζ και Kουέντιν Tαραντίνο στην ταινία Tέσσερα δωμάτια (1995), μια θεοπάλαβη κωμωδία σε τέσσερα μέρη. Tο κομμάτι της Άντερς, "Tο συστατικό που λείπει", αποτίει φόρο τιμής στο γυναικείο αρχέτυπο. H πέμπτη ταινία της Άντερς, Xάρη της καρδιάς μου (1996), είναι μια έξυπνη και ειλικρινής ματιά στην προσπάθεια μιας γυναίκας να βρει τη δική της φωνή στον ανδροκρατούμενο χώρο της μουσικής.

Mε πρωταγωνιστές τους Iλεάνα Nτάγκλας, Tζον Tορτούρο, Έρικ Στολτς και Mατ Nτίλον, η ταινία περιλαμβάνει πρωτότυπη μουσική γραμμένη από ντουέτα τραγουδοποιών παλιών και νέων, όπως οι Έλβις Kοστέλο και Mπερτ Mπάκαρακ, Nτέιβ Στιούαρτ και Kάρολ Mπέιερ Σέιγκερ, Λος Λόμπος και Tζέρι Γκόφιν. H τελευταία ταινία της, Sugar Town (1999), έχει ως θέμα τις παλιές δόξες και τα μελλοντικά αστέρια της βιομηχανίας της ροκ. H Άλισον Άντερς είναι μητέρα τριών παιδιών, κι αυτή την εποχή ζει στο Λονδίνο.